Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930556J24RikQ9D4U7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930556J24RikQ9D4U7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms