Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Erich6bQ9D4S6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Erich6bQ9D4S6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Erich6bQ9D4S6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Erich6bQ9D4S6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms