Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930578G10RikQ9D4Q4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
4930578G10RikQ9D4Q4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms