Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cul2Q9D4H8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cul2Q9D4H8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cul2Q9D4H8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul2Q9D4H8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.3 ms