Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmntd1Q9D4C1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmntd1Q9D4C1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd1Q9D4C1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd1Q9D4C1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms