Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rufy3Q9D394 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rufy3Q9D394 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rufy3Q9D394 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rufy3Q9D394 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rufy3Q9D394 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rufy3Q9D394 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rufy3Q9D394 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rufy3Q9D394 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rufy3Q9D394 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rufy3Q9D394 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms