Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F8

Toporsl, Topoisomerase I-binding, arginine/serine-rich-like, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ToporslQ9D2F8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ToporslQ9D2F8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ToporslQ9D2F8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ToporslQ9D2F8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ToporslQ9D2F8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ToporslQ9D2F8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms