Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4930583I09RikQ9D2E3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 602.2 ms