Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Necap2Q9D1J1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Necap2Q9D1J1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Necap2Q9D1J1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms