Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan11Q9D1D1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan11Q9D1D1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan11Q9D1D1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan11Q9D1D1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan11Q9D1D1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan11Q9D1D1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan11Q9D1D1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms