Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spc24Q9D083 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Spc24Q9D083 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Spc24Q9D083 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spc24Q9D083 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms