Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Shisa9Q9CZN4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Shisa9Q9CZN4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Shisa9Q9CZN4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms