Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9CYI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9CYI0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Q9CYI0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9CYI0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9CYI0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9CYI0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q9CYI0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9CYI0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9CYI0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms