Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd8Q9CX56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd8Q9CX56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd8Q9CX56 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd8Q9CX56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd8Q9CX56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms