Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RpainQ9CWY9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RpainQ9CWY9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RpainQ9CWY9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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