Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Khdc3Q9CWU5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Khdc3Q9CWU5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Khdc3Q9CWU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Khdc3Q9CWU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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