Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otud1Q9CUB6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otud1Q9CUB6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otud1Q9CUB6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Otud1Q9CUB6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms