Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Six6os1Q9CTN5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Six6os1Q9CTN5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Six6os1Q9CTN5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Six6os1Q9CTN5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Six6os1Q9CTN5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Six6os1Q9CTN5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Six6os1Q9CTN5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms