Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl28Q9CR40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl28Q9CR40 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl28Q9CR40 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Klhl28Q9CR40 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl28Q9CR40 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klhl28Q9CR40 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Klhl28Q9CR40 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl28Q9CR40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl28Q9CR40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.2 ms