Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gkn1Q9CR36 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gkn1Q9CR36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms