Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rer1Q9CQU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rer1Q9CQU3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rer1Q9CQU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms