Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf138Q9CQE0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf138Q9CQE0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf138Q9CQE0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf138Q9CQE0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms