Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chmp1b2Q9CQD4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chmp1b2Q9CQD4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chmp1b2Q9CQD4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms