Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab5aQ9CQD1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab5aQ9CQD1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab5aQ9CQD1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms