Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Med4Q9CQA5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Med4Q9CQA5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Med4Q9CQA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Med4Q9CQA5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Med4Q9CQA5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Med4Q9CQA5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Med4Q9CQA5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Med4Q9CQA5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Med4Q9CQA5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Med4Q9CQA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Med4Q9CQA5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Med4Q9CQA5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms