Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Rad54l2Q99NG0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rad54l2Q99NG0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rad54l2Q99NG0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rad54l2Q99NG0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Rad54l2Q99NG0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rad54l2Q99NG0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rad54l2Q99NG0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms