Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cadm3Q99N28 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cadm3Q99N28 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cadm3Q99N28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cadm3Q99N28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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