Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a6cQ99N08 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a6cQ99N08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a6cQ99N08 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms