Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp26Q99MX1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp26Q99MX1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp26Q99MX1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp26Q99MX1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms