Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col25a1Q99MQ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col25a1Q99MQ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col25a1Q99MQ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col25a1Q99MQ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms