Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SncaipQ99ME3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SncaipQ99ME3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SncaipQ99ME3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SncaipQ99ME3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms