Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tm2d1Q99MB3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tm2d1Q99MB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tm2d1Q99MB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms