Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pex6Q99LC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pex6Q99LC9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pex6Q99LC9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pex6Q99LC9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms