Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC2

Cstf1, Cleavage stimulation factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf1Q99LC2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cstf1Q99LC2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cstf1Q99LC2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cstf1Q99LC2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cstf1Q99LC2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cstf1Q99LC2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cstf1Q99LC2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cstf1Q99LC2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cstf1Q99LC2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms