Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nmd3Q99L48 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nmd3Q99L48 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nmd3Q99L48 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nmd3Q99L48 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms