Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q99KU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q99KU6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q99KU6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q99KU6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q99KU6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q99KU6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q99KU6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q99KU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q99KU6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q99KU6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q99KU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q99KU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q99KU6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q99KU6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q99KU6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q99KU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q99KU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q99KU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q99KU6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q99KU6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q99KU6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q99KU6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q99KU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q99KU6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q99KU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q99KU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q99KU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q99KU6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q99KU6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q99KU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q99KU6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q99KU6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q99KU6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q99KU6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q99KU6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q99KU6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q99KU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q99KU6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q99KU6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q99KU6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q99KU6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q99KU6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q99KU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q99KU6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q99KU6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q99KU6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q99KU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q99KU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q99KU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q99KU6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q99KU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q99KU6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q99KU6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q99KU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q99KU6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q99KU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q99KU6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q99KU6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q99KU6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q99KU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q99KU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q99KU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q99KU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q99KU6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q99KU6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q99KU6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q99KU6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q99KU6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q99KU6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q99KU6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q99KU6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q99KU6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q99KU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q99KU6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q99KU6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q99KU6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q99KU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q99KU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q99KU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q99KU6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q99KU6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q99KU6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q99KU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q99KU6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q99KU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms