Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR8

Fuca2, Plasma alpha-L-fucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fuca2Q99KR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fuca2Q99KR8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fuca2Q99KR8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fuca2Q99KR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fuca2Q99KR8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fuca2Q99KR8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms