Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tcf19Q99KJ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tcf19Q99KJ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tcf19Q99KJ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms