Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ferd3lQ923Z4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ferd3lQ923Z4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ferd3lQ923Z4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ferd3lQ923Z4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms