Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SncbQ91ZZ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SncbQ91ZZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SncbQ91ZZ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SncbQ91ZZ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SncbQ91ZZ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms