Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cts3Q91ZD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cts3Q91ZD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cts3Q91ZD5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms