Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD4

Vangl2, Vang-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl2Q91ZD4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vangl2Q91ZD4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vangl2Q91ZD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vangl2Q91ZD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vangl2Q91ZD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Vangl2Q91ZD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms