Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Basp1Q91XV3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Basp1Q91XV3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Basp1Q91XV3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Basp1Q91XV3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.5 ms