Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prb1Q91X93 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prb1Q91X93 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prb1Q91X93 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prb1Q91X93 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prb1Q91X93 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prb1Q91X93 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prb1Q91X93 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prb1Q91X93 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms