Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Csde1Q91W50 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Csde1Q91W50 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Csde1Q91W50 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Csde1Q91W50 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csde1Q91W50 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms