Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klc3Q91W40 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Klc3Q91W40 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klc3Q91W40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Klc3Q91W40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Klc3Q91W40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Klc3Q91W40 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms