Protein–RNA interactions for Protein: Q91VN0

Lrp5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp5Q91VN0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrp5Q91VN0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lrp5Q91VN0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrp5Q91VN0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrp5Q91VN0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrp5Q91VN0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrp5Q91VN0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lrp5Q91VN0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrp5Q91VN0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrp5Q91VN0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrp5Q91VN0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrp5Q91VN0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrp5Q91VN0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms