Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul7Q8VE73 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cul7Q8VE73 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cul7Q8VE73 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Cul7Q8VE73 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cul7Q8VE73 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cul7Q8VE73 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms