Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx18Q8VDS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx18Q8VDS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx18Q8VDS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx18Q8VDS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx18Q8VDS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms