Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cbx7Q8VDS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cbx7Q8VDS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cbx7Q8VDS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cbx7Q8VDS3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms